Веспер живёт в мире, где привычные концепции жизни перевернулись с ног на голову. Катастрофа, вызванная созданием генетиками новых вирусов и организмов, уничтожила большую часть растений и животных, а также значительную часть человечества. Те, кто выжили, разделились на две группы: избранные, спрятавшиеся в укреплённых цитаделях, и остальные, вынужденные выживать в суровых условиях. Веспер, 13-летняя девочка, живёт со своим парализованным отцом и постоянно занимается экспериментами в надежде вывести новые виды растений и взломать генетический код семян, которые позволили бы выживать за пределами цитаделей.
Однажды Веспер наталкивается на обломки глайдера, потерпевшего крушение неподалёку от её дома. Она находит раненую женщину, которую решает спасти, надеясь на то, что та обладает информацией о цитаделях и может помочь ей туда попасть. Женщина, как оказывается, действительно связана с цитаделями, её имя Камриддиа, и она является одним из учёных, работающих над генетическими исследованиями.
Между Веспер и Камриддиа устанавливается особая связь, они обе понимают, что могут помочь друг другу. Веспер хочет использовать знания Камриддии, чтобы попытаться изменить существующий порядок вещей и дать шанс тем, кто живёт вне цитаделей. Они вместе начинают работать над секретным проектом, целью которого становится создание новых семян, способных размножаться и расти в дикой природе без ограничений.
Однако их деятельность привлекает внимание властей цитаделей, которые намерены сохранить своё монопольное положение в вопросах производства и распространения пищи. Веспер и Камриддии приходится скрываться и переходить от одной опасной ситуации к другой, пытаясь обойти системы слежения и избегая преследователей.
На фоне всех этих событий Веспер сталкивается с личными испытаниями: ей приходится заботиться о своём отце, который хоть и парализован, но является её единственной семьёй и поддержкой. В конце концов, их усилия начинают приносить плоды, и они создают семена, которые могут изменить судьбу человечества, дав ему шанс на новое начало.
